Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole3Q9JKP7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms