Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms