Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms