Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssna1Q9JJ94 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssna1Q9JJ94 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms