Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cml1Q9JIZ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cml1Q9JIZ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms