Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad9Q9JIW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smad9Q9JIW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms