Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1fQ9JIS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cacna1fQ9JIS7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1fQ9JIS7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms