Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt1Q9JIF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prmt1Q9JIF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms