Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl1Q9JI74 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl1Q9JI74 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms