Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus3Q9JI38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus3Q9JI38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms