Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl11Q9JHH5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl11Q9JHH5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms