Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn12Q9ET43 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms