Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a4aQ9ET37 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a4aQ9ET37 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms