Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Brd4Q9ESU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Brd4Q9ESU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms