Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp29Q9ES63 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp29Q9ES63 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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