Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc4Q9ES56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms