Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenofQ9ERR7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms