Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cse1lQ9ERK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cse1lQ9ERK4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cse1lQ9ERK4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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