Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn12Q9ER56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn12Q9ER56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms