Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Igdcc4Q9EQS9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igdcc4Q9EQS9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igdcc4Q9EQS9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms