Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndst3Q9EQH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndst3Q9EQH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndst3Q9EQH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms