Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms