Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms