Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cbx6Q9DBY5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx6Q9DBY5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms