Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf6Q9DBU5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms