Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg9Q9DB90 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms