Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf580Q9DB38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms