Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asf1bQ9DAP7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Asf1bQ9DAP7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms