Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700012A03RikQ9DAF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
1700012A03RikQ9DAF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms