Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sgf29Q9DA08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sgf29Q9DA08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sgf29Q9DA08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sgf29Q9DA08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms