Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34b2Q9D9N2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34b2Q9D9N2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34b2Q9D9N2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms