Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9D9H8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9D9H8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9D9H8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Q9D9H8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9D9H8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q9D9H8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9D9H8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9D9H8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9D9H8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9D9H8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9D9H8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms