Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg7Q9D906 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg7Q9D906 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms