Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms