Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4bQ9D8B3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chmp4bQ9D8B3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms