Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1Q9D883 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
U2af1Q9D883 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms