Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms