Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp5Q9D7S9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms