Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmigd1Q9D7L8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms