Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm5Q9D7I9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm5Q9D7I9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm5Q9D7I9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms