Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms