Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms