Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pabpc6Q9D4E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms