Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpn3Q9D3W4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms