Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms