Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms