Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hddc3Q9D114 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms