Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tmem88Q9D0N8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88Q9D0N8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms