Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbed3Q9D0L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbed3Q9D0L1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms