Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ribc1Q9D0B8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ribc1Q9D0B8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms